O Laser cirúrgico provoca um conjunto de efeitos e reacções importantes:

1º. Marcado efeito térmico da transformação da energia luminosa por fenómenos de fluorescência e efeitos fotoquímicos que se convertem em calor;

2º. Efeito de desidratação local subsequente ao efeito térmico referido, com acentuada contracção dos tecidos;

3º. Efeito de coagulação dependente da quantidade de energia luminosa emitida, a qual pode provocar um aumento de temperatura entre 42ºC e 70ºC o que, em elementos proteícos, origina a coagulação do tecido;

4º. O efeito de vaporização dos tecidos é provocado pela energia luminosa, energia esta que se transforma em calor num curto espaço de tempo;

5º. O efeito de carbonização dos tecidos a irradiar, que se obtém instantaneamente, quando a temperatura supera 100ºC.

A aplicação do Laser cirúrgico tem como base o seu efeito térmico.
No entanto, possui outra característica: o efeito fotoquímico. Este só se obtém utilizando baixas potências e longas exposições.